Bộ Khoa học và Công nghệ có 25 đơn vị
Bộ Khoa học và Công nghệ mới có 25 đơn vị, gồm 22 tổ chức hành chính và 3 đơn vị sự nghiệp công lập phục vụ chức năng quản lý nhà nước của Bộ.

Chính phủ ban hành Nghị định số 55/2025/NĐ-CP ngày 2-3-2025 quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Bộ Khoa học và Công nghệ. Nghị định có hiệu lực từ ngày 1-3-2025.
Bộ Khoa học và Công nghệ được thành lập trên cơ sở hợp nhất Bộ Thông tin và Truyền thông với Bộ Khoa học và Công nghệ (cũ). Riêng các lĩnh vực nhiệm vụ quản lý nhà nước của Bộ Thông tin và Truyền thông về bảo đảm an toàn thông tin mạng bàn giao sang Bộ Công an; quản lý nhà nước về báo chí, xuất bản sang Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch.
Bộ Khoa học và Công nghệ là cơ quan của Chính phủ, thực hiện chức năng quản lý nhà nước về hoạt động nghiên cứu khoa học, phát triển công nghệ, đổi mới sáng tạo, phát triển công nghệ cao, công nghệ chiến lược, phát triển tiềm lực khoa học và công nghệ.
Bộ Khoa học và Công nghệ cũng thực hiện chức năng quản lý nhà nước về sở hữu trí tuệ; tiêu chuẩn đo lường chất lượng; năng lượng nguyên tử, an toàn bức xạ và hạt nhân; bưu chính; viễn thông; tần số vô tuyến điện; công nghiệp công nghệ thông tin, công nghiệp công nghệ số; ứng dụng công nghệ thông tin; giao dịch điện tử; chuyển đổi số quốc gia; quản lý nhà nước đối với các dịch vụ công thuộc ngành, lĩnh vực quản lý của bộ theo quy định của pháp luật.
Bộ Khoa học và Công nghệ thực hiện các nhiệm vụ, quyền hạn theo quy định của Luật Tổ chức Chính phủ, quy định của Chính phủ về chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của bộ, cơ quan ngang bộ và 37 nhiệm vụ, quyền hạn cụ thể.
Về cơ cấu tổ chức, Bộ Khoa học và Công nghệ mới có 25 đơn vị gồm 22 tổ chức hành chính giúp Bộ trưởng thực hiện chức năng quản lý nhà nước và 3 đơn vị sự nghiệp công lập phục vụ chức năng quản lý nhà nước của Bộ.
Tại Nghị định, Chính phủ cũng hướng dẫn: Học viện Khoa học, Công nghệ và Đổi mới sáng tạo, Tạp chí Khoa học và công nghệ Việt Nam, Viện Chiến lược Thông tin và Truyền thông, Trường Đào tạo, Bồi dưỡng cán bộ quản lý thông tin và truyền thông, Tạp chí Thông tin và Truyền thông tiếp tục hoạt động cho đến khi Thủ tướng Chính phủ ban hành quyết định quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Học viện Chiến lược khoa học và công nghệ; thời gian thực hiện không quá 3 tháng kể từ khi Nghị định này có hiệu lực thi hành.
Cục An toàn thông tin tiếp tục duy trì hoạt động để xử lý các vấn đề về tài chính, ngân sách nhà nước, tài sản công, các chương trình, dự án; nhân sự và các vấn đề còn tồn đọng khác (nếu có) trong thời gian không quá 3 tháng kể từ khi Nghị định này có hiệu lực thi hành.